По мнению Ходорковского, находящегося в заключении с 2003 года, происходящее в России "крушение права" угрожает тяжелыми последствиями для всей страны. Поэтому, когда в громком процессе всплывают факты, свидетельствующие о несамостоятельности судьи, глава государства обязан дать поручение об организации действительно независимого расследования этих фактов.
Ходорковский указывает, что имеет в виду дело, по которому в декабре 2010 года он был приговорен к 14 годам лишения свободы. В письме Медведеву он приводит примеры "демонстративного правового нигилизма в чудовищном приговоре, увенчавшем знаковый процесс". В приговоре Хамовнического суда, напоминает Ходорковский, в частности говорится, что сделки по приобретению продукции головной компанией у "дочек" являются хищением, а справедливая цена нефти на промыслах в Сибири - это цена в Роттердаме, несмотря на таможенные пошлины и транспортные издержки.
Бывший глава "ЮКОСа" подчеркивает, что у него есть некие доказательства несамостоятельности судьи Виктора Данилкина, причем они не сводятся только к "скандальному выступлению премьер-министра" (напомним, Владимир Путин незадолго до вынесения приговора Ходорковскому заявил, что "вор должен сидеть в тюрьме", а позже пояснил, что речь шла о первом деле, приговор по которому вступил в законную силу). Перечислять эти доказательства до назначения расследования Ходорковский не стал.
Как считает Ходорковский, усугубляющийся правовой нигилизм судей является вопиющим нарушением прав граждан, и президент как гарант этих прав должен положить конец расширительному толкованию уголовного закона. "Конечно, если суд нагло не исполняет закон, а президент страны не имеет возможностей ситуацию изменить, наступает конституционный кризис. Но, к счастью, пока до этого не дошло", - отмечает заключенный.
Ходорковский подчеркивает, что не предлагал президенту давить на суд или диктовать ему. "Напротив, я предлагаю избавить его от давления, демонстративного и скрытого, от унизительной роли придатка репрессивной системы и объекта манипулирования с ее стороны", - поясняет бывший глава "ЮКОСа".
В статье для "Ведомостей" автор также поясняет, что правовой нигилизм несовместим с модернизацией и инвестициями. "Чем в таких условиях Россия привлекательна для авантюристов и казнокрадов, понятно - но как привлечь и сохранить серьезных инвесторов, интеллектуалов, которым открыт весь мир? Многократным завышением нормы прибыли? Личными гарантиями премьера? Это такие модернизационные инструменты ХХI века?", - задается вопросом Ходорковский.
О существовании письма Ходорковского Медведеву 31 января сообщили "Ведомости" со ссылкой на британскую газету The Times, к которой попала копия документа. Между тем на сайте пресс-центра Ходорковского открытое письмо президенту не упоминается.
30 декабря 2010 года Ходорковский и глава группы "МЕНАТЕП" Платон Лебедев были приговорены к 14 годам лишения свободы. Приговор вынесен с учетом срока, уже проведенного ими в тюрьме, то есть на свободу они выйдут не ранее 2017 года.