Жалобу на возобновление следствия по делу Магнитского подала его мать Наталья Магнитская. При этом не уточнялось, от кого требовалось прекратить дело.
Магнитского обвиняли в оказании помощи по организации схемы ухода от налогов инвестфонду Hermitage Capital, в котором он работал консультантом. В ноябре 2009 года он скончался в СИЗО, и дело было закрыто в связи с его смертью по нереабилитирующим обстоятельствам.
В июле 2011 года Конституционный суд РФ наделил родственников умерших фигурантов уголовных дел правом требовать возобновления расследования в целях реабилитации скончавшегося и установления истины. В начале августа 2011 года Генпрокуратура РФ по собственной инициативе потребовала от Следственного департамента МВД возобновить расследование прекращенного уголовного дела в отношении Магнитского.
В МВД объяснили, что только выполняли указание Генпрокуратуры и именно ее решение надлежит обжаловать в суде. Вместе с тем в Следственном департаменте отметили, что могут закрыть дело только после получения согласия всех близких родственников Магнитского, для чего предварительно требуется их установить.
Вдова Магнитского ранее уже возражала против возобновления дела, а его мать утверждала, что уголовное преследование ее сына осуществлялось незаконно.
Президентская комиссия по правам человека также пришла к выводу, что были оставлены без внимания заявления Магнитского о том, что расследованием его дела занимаются сотрудники МВД, которых он обвинял в хищении из бюджета 5,4 миллиарда рублей.
Родственники и коллеги Магнитского утверждали, что консультант инвестфонда умер из-за преднамеренного неоказания ему медицинской помощи. В ходе расследования его смерти были возбуждены уголовные дела на лечащего врача СИЗО "Бутырка" и замначальника СИЗО по лечебно-профилактической работе.